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1.材料技術研究中心
研究和開發先進複合材料技術及其應用，包括獨特的設計、分析、製造以及結構性能評估。
2.大氣研究中心
全面了解和分析香港及珠三角地區的空氣質量，並協助發展一套有效的區域空氣質量監督和管理政策。
3.工程材料及可靠性研究中心
進行集成電路封裝、材料特性的確認、結構可靠性、新材料開發等領域研究。
4.人口與社會分析中心
開展具有深遠影響的社會人口分析項目，開設相關培訓課程，研討會及關於社會人口分析問題研究方案的會議。
5.數字生活研究中心
促進「無縫數字生活」的概念，及展示無處不在的嵌入式技術對生活的影響。研究焦點集中在流動裝置、射頻識別、感應器及無線技術。
6.北京－香港科大聯合研究中心
在香港科技大學和北京科技大學的緊密合作下，研究和分析各種工程使用材料，包括核電廠中的材料。
7.華南研究中心
致力於研究和學術交流，為研究南沙和珠三角地區的本土文化、歷史、社會文化網絡和區域一體化，研究華南地區和中國海外華僑的聯繫，以及經濟和環境對文化的影響進行數據收集和分析。
8.無限通訊集成電路設計中心
為新一代超寬帶（UWB）技術，研究發展先進無線通訊系統及無線專用集成電路的設計。
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