連接T3C、T3D兩大區域的捷運系統站台都設在二層。為了方便旅客，捷運站台沒有設在航站樓最底層，而是設在地面二層，無人駕駛的列車從T3C出站後慢慢下坡到地面，接近T3D時又緩緩爬坡進到二層站台，這樣，國際旅客從捷運列車下車後直接就進入了離港或到港區域，步行距離大大壓縮，尤其避免了到最頂層辦票，再到最底層坐捷運列車的周折。新航站樓還安裝了4.8公里的自動步道，減少旅客行走距離。此外，獨立的殘疾人和母嬰衛生間、鐘點房、數碼港、祈禱室等人性化設施也將為旅客帶來更多愉悅體驗。
