07至08年度，該署經營104個公眾街市共虧損1.6億元。(06至07年度，百多個公眾街市中，有84個錄得虧損，當中有11個街市虧損518至869萬元不等)
05至08年，3個年度該署未向街市檔戶收回代繳的差餉，總額涉及6,780萬元，即每年平均2,260萬元。
全港共31個公眾街市已安裝空調系統，但審計署發現每年5,300萬元的空調成本中，食環署只收回3,400萬元，即每年仍未收回的費用約1,100萬元。
總計：食環署經營公眾街市平均每年虧損1.936億元。 資料來源：審計署報告
