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2008年9月25日 特偵組搜索陳水扁辦公室時，查扣44箱、1300餘件資料，當中有大批「總統府」內敏感文件、公文。
2010年9月10日 「總統府」告發陳水扁卸任時攜走「總統府」文件；特偵組分案偵辦。
2010年9月15日 特偵組搜索扁辦及陳水扁當時被羈押的北所舍房，查扣58箱文件；啟封後查出包括機密文件及非機密文件688件。
2010年10月起 特偵組會同「總統府」等機關審核文
至2012年初 件、函文是否涉及機密。
2012年2月14日 特偵組提訊在台北監獄服刑的陳水扁，提示被核定為機密的文件，要求扁說明。
2012年2月21日 特偵組檢察官赴台北監獄就訊陳水扁；因扁感冒不舒服、扁桃腺發炎，查案進度有限。
2012年3月27日 特偵組再赴台北監獄就訊陳水扁。
2012年5月21日 偵查終結，陳水扁被起訴以侵佔公物、隱匿公務員職務上掌管文書及違反機密保護法等罪。 ■中央社
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