化學風險
•避免使用化學藥、除害劑和獸藥，可減少化學物質殘餘量。
•避免使用殺真菌劑，可能會導致霉菌在農作物生長，繼而產生霉菌毒素；不過現時沒有足夠證據顯示，使用殺真菌劑可減少霉菌在農作物中產生霉菌素的情況。
微生物風險
•在有機耕作時使用未經適當處理的肥料，可能令食品和附近水源受到致病菌污染；但沒有足夠證據顯示有機耕作會較一般耕作更易傳播致病菌。
營養成分
•有機食物的營養成分，包括維他命或礦物質的含量，跟一般食物基本上相同。
