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合肥是國家首批創新型試點市，合蕪蚌位列內地四大自主創新示範區之一，與北京中關村、武漢東湖、上海張江並列，享受國家鼓勵創新的各項政策。2008年，合蕪蚌自主創新綜合試驗區啟動建設以來，合肥的自主創新已取得巨大進展。「十二五」時期，合肥將力爭實現戰略性新興產業產值、高新技術與創新型企業數、發明專利授權量、轉化科技成果數、引進高端人才數、創業風險投資總量翻兩番，在內地率先建成創新型城市。
欲建創新型城市領先內地
合肥是中國重要的科教基地，擁有一批高端科研機構和大科學裝置。在中科院合肥物質科學研究院，正在運行的全超導托卡馬克裝置（俗稱「人造小太陽」），是國家大科學裝置落戶合肥的代表，也是中國自行設計研製的世界上第一個全超導托卡馬克核聚變實驗裝置。今年7月份，該裝置在試驗中創造了新的世界紀錄—超過400秒的高溫等離子體、穩定重複超過30秒的高約束等離子體放電。科研人員介紹說：「這個裝置看起來像工業鍋爐，實際上它的工作原理像太陽或氫彈」，通過該裝置有望實現可控制的核聚變反應，打造一個「人造太陽」，解決人類面臨的能源短缺問題。
四大政策形成創新發展模式
圍繞自主創新，合肥市建立了高層面、跨部門的科技管理體制，出台自主創新、新型工業化、現代服務業、現代農業四大政策體系，形成「政府引導、體制創新、要素集聚、重點突破」的創新發展模式。
目前，合肥高新技術產業增加值佔生產總值比重已由17.8%提高到22.1%。2008年以來的5年間，合肥的高新技術產業增加值、專利授權量、企業創新平台載體數、引進高端人才數等四項創新指標，均實現增長翻番。
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