聖母院歷史悠久，不但收藏大量宗教聖物和藝術品，一磚一瓦以至每扇窗戶均極具歷史價值。在前日的大火中，消防員成功搶救多項文物，但仍有部分珍貴藏品狀況不明，屋頂的木造部分和尖塔亦被摧毀。
玫瑰窗
分別設於聖母院北、南、西側外牆，當中以西側玫瑰窗歷史最久，於1225年建成。玫瑰窗裝嵌多塊彩繪玻璃，其中南、北兩面玫瑰窗分別描繪十二門徒，以及聖母和聖嬰的故事。
未受火舌直接焚燒，但由於聖母院建築結構受破壞，加上曾受高溫影響，玫瑰窗仍未算「脫險」。
耶穌受難荊棘冠
相傳是耶穌被釘十字架前，遭羅馬士兵強行戴上的荊棘冠，被視為基督教最珍貴聖物，地位崇高。在火警中由消防隊司鐸富尼耶帶走。
十二門徒像
在火災前因聖母院維修工程被吊走，倖免於難。
雙塔
位於聖母院西側，分別於1240年及1250年建成，樓高68米，是巴黎自19世紀末艾菲爾鐵塔建成前最高建築。塔內設有387級樓梯，訪客可俯瞰巴黎景致。未受大火破壞。
聖路易祭袍
法國皇帝路易九世使用的祭袍，被譽為「法蘭西護身符」，在火警中獲帶離火場。
十字架碎片、十字架釘
相傳是耶穌被釘的十字架一部分。未知是否獲救。
其他文物
聖母院亦有無數聖像和油畫，其中一批油畫共有76幅，描繪《宗徒大事錄》多個場景，未知是否在火警中安全轉移。
大鐘
聖母院設有10個大鐘，以位於南塔、1685年啟用的「伊曼紐爾」最大，重量近13噸。每逢法國發生重大事件，伊曼紐爾大鐘均會鳴響，包括1944年巴黎解放。
大管風琴
設有逾8,000支音管，是世界最知名的管風琴之一，部分音管歷史逾800年。未被火警摧毀，但未知音管在消防員灌救期間有否入水。
滴水石獸
聖母院頂部有多隻滴水石獸，協助屋頂排水，石獸大多集不同動物特徵於一身，以正面的「Strype」最著名。