廣州再生醫學與健康實驗室：依託中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院和粵港澳地區的相關優勢科研力量建設。主要攻關方向為幹細胞與再生醫學。
深圳網絡空間科學與技術實驗室（鵬城實驗室）：哈爾濱工業大學（深圳）為主要依託單位，協同清華大學、北京大學、深圳大學、南方科技大學、香港中文大學（深圳）、中國航天科技集團、中國電子信息產業集團、深圳國家超算中心、華為、中興通訊、騰訊等單位共建。學術方向和應用為網絡通信，人工智能和網絡安全。
東莞松山湖材料實驗室：由東莞市政府、中科院物理所和東莞中子科學中心共建，立足於建設成有國際影響力的新材料研發南方基地，使之成為國家物質科學研究的重要組成部分，成為粵港澳交叉開放的新窗口。
佛山季華實驗室：參與建設的單位包括清華大學、復旦大學、中科院長春光機所、中科院微電子所、中科院蘇州醫工所以及廣東工業大學，以及港澳一批知名高校和科研院所，聚焦先進製造科學與技術。
整理：香港文匯報記者 敖敏輝