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■中國水產科學院黃海水產研究所陳松林在進行半滑舌鰨取樣。左圖為半滑舌鰨基因組分析結果。本報深圳傳真
【本報廣東新聞中心記者郭若溪、實習記者龍彥宇、通訊員王靜思深圳10日電】日前，中國基因組研究團隊同日宣佈完成牡蠣及半滑舌鰨基因組序列圖譜繪製。牡蠣及半滑舌鰨基因組測序的完成，標誌著中國水產生物研究進入了基因組時代，在水產生物研究過程中具有里程碑的意義。
由中國科學院海洋研究所、深圳華大基因研究院等單位組成的牡蠣基因組研究團隊日前在青島宣佈牡蠣基因組序列圖譜繪製完成。同日，中國水產科學研究院黃海水產研究所和深圳華大基因研究院在北京聯合宣佈繪製出半滑舌鰨全基因組序列圖譜。
兩圖譜皆創國際先河
據介紹，牡蠣是目前已測序生物中拼接難度最大的物種。深圳華大基因研究院特別開發了針對高雜合度基因組的短序列片段拼接新算法，利用分級組裝新手段，成功解決了高雜合度物種基因組測序的技術問題，歷時兩年，繪製出了世界上第一張以雙殼貝類為代表的經濟軟體動物完整的全基因組序列圖譜。
半滑舌鰨全基因組測序和基因圖譜繪製研究項目運用一系列序列拼接組裝和分析軟件，繪製了半滑舌鰨基因組圖譜。研究發現，半滑舌鰨基因組大小為520Mb（5.2億個核甘酸），重複序列含量為9.5%，發現的基因為2萬多個，其中18,000多個基因與其它物種具有不同程度的同源性，2,000多個基因未找到同源基因。這是中國完成的第一個魚類基因組測序項目和全基因組序列圖譜，使半滑舌鰨成為世界上第一個測定了全基因組序列的鰈形目魚類。
據了解，為進一步推動基因組學研究在水產養殖的應用發展，華大基因還將於2010年9月底在深圳舉辦國際魚類基因組研討會。11月17日與中科院海洋研究所聯合舉辦第五屆國際基因組學大會。
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