■王芸生在重慶《大公報》編輯部。抗戰的勝利曾給王芸生帶來曇花一現的希望，他當時的社評《日本投降了》、《毛澤東先生來了》都顯得那麼樂觀。他還為馬歇爾來華、停戰令、三人軍事小組、政協會議的召開喝過彩。在國共兩黨對決的夾縫中，王芸生一直堅持獨立的民間立場，他都以理性分析來發表見解。但當國民黨的腐敗、無能日漸顯現，乃至病入膏肓之時，《大公報》對國民黨的批評也愈發尖銳。
1947，王芸生在《我看學潮》一文呼籲「趕快停戰，快快和平！」，並對學運作了大量客觀報道。國民黨政府教育部為了防止學運擴散，頒佈《學生自治會規則》，《大公報》的李純青發表社評，指責國民黨政府對學生運動的干涉和鎮壓。蔣介石看了勃然大怒，授意南京《中央日報》發表社論給《大公報》加了一串罪名後，指名道姓地對王芸生進行人身攻擊。
不懼圍攻 坦然回應
1948年7月19日，《中央日報》以《王芸生之第三查》為題發表社論，對王芸生的「反蔣罪行」，進行徹底「清算」。這「三查」都是莫須有的，無非是給《大公報》羅織罪名。《中央日報》如此叫罵，氣勢洶洶，各右派報紙聞聲而起，紛紛「圍剿」王芸生。
1948年7月8日，國民黨政府當局勒令南京《新民報》「永久停刊」。王芸生發表社評聲援《新民報》，宣稱「言論與發表的自由，是人民的基本權利之一」，但很快《中央日報》就發表社論大罵王芸生。
1948年夏，正當王芸生遭受圍攻，思想陷於彷徨苦悶、無所適從之際，10月30日，中共上海地下黨組織派人通知他，毛澤東主席邀請他到北京參加新政協。他萬分高興，便離滬繞道台灣到了香港。
面對國民黨《中央日報》的「三查」和各種指責、謾罵，王芸生坦然回應，毫不畏怯，他曾對家人說過：「我作為一份民間報紙的發言人，要保持自己獨立的人格，我才有獨立的發言權，我才有資格說真話，對國民黨才能嬉笑怒罵。同時，待國共雙方都必須一樣，是我一貫的原則。」