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城大3名研究生(左起)張文平、徐小雅及陳寅,獲得全國研究生數學建模競賽一等獎。香港文匯報記者歐陽子瑩 攝
——篩出致癌基因揚威全國賽 報告獲薦登國際專業期刊
香港文匯報訊(記者 歐陽子瑩)香港城市大學3名內地研究生,運用數學分析方法,得出能夠篩選出致癌基因、準確度高達85%的數學建模,對預測癌症起重要作用。有關研究方案在全國研究生數學建模競賽中,從2,000個隊伍中脫穎而出,榮獲一等獎及表現最佳的首5名,獲大會推薦以論文形式發表於國際專業期刊。
每年舉辦一次的全國研究生數學建模競賽,由內地超過26所大學的研究生院發起,今年已進入第7屆,共有來自229所大專院校的1,995支隊伍參加,涉及的參賽研究生近6,000名。城大3名參賽學生包括電腦科學系碩士畢業生徐小雅、資訊系統學系碩士畢業生張文平和製造工程及工程管理學系博士生陳寅。
數據圖像化助分析
其實他們3人對癌症及物理的認識不多,但卻一致選擇了「確定腫瘤的重要基因信息」為研究題目。陳寅表示,做研究的目的是希望將理論與現實結合並應用,因此也希望利用數學找出有助治療癌症的方法。
大會題目要求參賽者透過提取基因圖譜信息,包括將基因分類、建立可以確定基因標籤的數學模型等,他們要從2,000組真實的基因數據中,篩選出與大腸癌關係最密切的基因。為將基因分門別類,陳寅與組員運用了3個數學分析方法,包括關聯分析(Associate Analysis)、特徵篩選(Feature Selection)及去噪(Denoising)。透過去噪,他們將抽象的基因數據轉化成圖像,經過分析癌症基因及非癌症基因圖的顏色等資料,成功找出變化差異最大的基因,最後篩選出6個關鍵的致癌基因,準確度高達85%。
有望助預知會否患癌
陳寅表示,數學的好處是可以將抽象的東西量化,然後透過數據分析獲得訊息,「若能透過有關方案檢測出抑遏基因的變異,有助預知是否會患上癌症」。正於城大擔任研究助理的徐小雅及張文平則稱,他們的方案除可應用於大腸癌,也可以應用於其他癌症。3人的研究報告榮獲競賽一等獎,並成為最佳的5份報告之一,獲大會推薦,稍後將發表於國際專業期刊。
上述競賽於去年9月17至20日舉行,主辦單位於比賽當日在網上公布4個試題,參賽者以3人為一隊,任選其中一題作答,並需於4日內提交解決方案。今年共有61支隊伍獲一等獎;273隊獲二等獎;448隊獲三等獎。
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