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香港回歸12載，粵港合作從民間轉至官方，中共中央政治局委員、廣東省委書記汪洋到任廣東後，首次會面即提到兩地「血脈相連，唇齒相依」。此後一年之內，汪洋與香港特首曾蔭權4次會面，粵港合作空前升溫。
今年年初，溫家寶總理更在《政府工作報告》中，提及「粵港澳合作」內容。而在國務院發佈去年年底通過的《珠三角改革發展規劃綱要》中，涉及粵港澳合作的內容多達112處，將粵港合作上升到國家戰略。
香港回歸前，粵港合作主要停留在民間層面，香港回歸後，粵港之間交流日趨緊密，為此，1998年3月，香港特區政府與廣東省召開了粵港合作聯席會議，並商定這個會議每年召開一次。在中央和粵港雙方政府的推動下，粵港雙方的主要合作動力也從民間提升到政府層面，政府間的合作逐漸加大，2001年6月19日，廣東省掛牌成立了港澳事務辦公室，與省外辦合署辦公，外辦內保留港澳處，承辦具體事務。
粵港聯席會議升格
2003年，在CEPA簽署後首次召開的第六次粵港合作聯席會議建立了新的架構和新的機制，將原來的「雙首長制」升格為雙方行政首腦出面主持的粵港合作聯席會議制度，並對應成立相應機構，負責日常具體事務。粵港合作聯席會議下設若干專責小組，對各專題合作項目負責研究、跟進、落實。
粵港互派公務員交流
2006年3月，原與外辦合署辦公的廣東省港澳事務辦公室正式掛牌，三天後的4月1日，香港特區政府政制事務局正式成立內地事務聯絡辦公室，進一步加強統籌處理內地事務的職能。此舉顯示，內地與香港的經貿、政治關係更加緊密。
2004年12月，粵港兩地政府簽署《廣東省和香港兩地公務員實習交流活動協議書》(05-06年)兩年，廣東共選派24名公務員到香港相關部門實習交流，同時接收14名港方公務員到廣東相關機構實習交流。兩地高校亦設置相應課程，每年接待對方公務員交流與學習。
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