香港大學深圳研究院 2011年成立
◆致力發展高新知識轉移、產業孵化，引進重點實驗室和研發中心，培養複合型科研人才，從而加強港大與深圳、珠三角以及整個內地業界的合作夥伴關係。
香港科技大學深圳研究院 2001年成立
◆是科大承擔國家、區域重大科研項目，參與國家戰略發展的重要平台，也是連接深港兩地科研和學術交流的橋樑。
香港浸會大學深圳研究院 2002年成立
◆以「創新科研」為宗旨的研究發展基地。下轄研究中心匯聚浸大最具科研實力及科研優勢的兩大學院──理學院及中醫藥學院，也薈萃了數十名來自香港及內地的科研精英，在深圳開展創新研究、推動跨學科的合作項目，並進一步促進科研成果轉化。
香港中文大學深圳研究院 2007年成立
◆重點推動生物醫藥、信息科技及可持續發展等領域的科研發展。目前已建立4個國家重點實驗室的深圳基地。旨在為深圳、大灣區乃至全國培養優秀人才，為業界在相關領域的技術進步提供技術與理論支持。
香港理工大學深圳研究院 2000年成立
◆設有10多個實驗室及科研平台，承擔國家、省市各級政府及業界科研項目，孵化了一批優秀的理大創業團隊。
香港城市大學深圳研究院 2001年成立
◆研發中心的數目已達13所，另有4所專業實驗室。多年來承擔了超過600項國家、省市及香港的科研項目。