五層：真功夫、麥當勞等餐飲區
四層：辦理乘機手續；國內出港安全檢查；行李打包；行李寄存及失物招領；超大行李托運。
三層：國際(地區)航班出發聯檢（主樓）；國內航班候機區；國際航班候機區（東翼廊）。
二層：國內旅客到達；國內航班行李提取；國內迎客區。
一層：國際聯檢大廳；國際行李提取廳；國際到達迎客廳；國內遠機位候機區（十字指廊）；國際遠機位候機區（東翼廊）。
負一層：地鐵11號線、深港快線(未開通)；航站樓捷運系統(未開通)。
