60多年來，吳芝生研習中國傳統文化，不斷摸索和探討軟木畫的技巧，將軟木畫與海峽兩岸文化、宗教文化、旅遊文化充分融合，其創作的《湄洲媽祖風光》《武夷風光》《閩都古韻》《海西園林方罩》等精品榮膺國家級金獎、銀獎、一等獎、優秀獎不計其數，經海外展出後，被許多藝術品收藏者珍藏。
香港文匯報記者採訪當日，在他的創作室看到了滿滿一房間的獲獎作品，其中一幅巨大的《湄洲媽祖風光》最引人注目，雖然只有1米長，但畫中的亭台樓閣有334間，房簷樑柱1,112件，曾獲得全國工藝美術展覽金獎，亦是他最引以為豪的作品之一。而他最在意的不是那栩栩如生、令人歎為觀止的亭台樓閣，而是作品中蘊含的意義。「媽祖象徵着和平，是兩岸人民共同敬仰的女神。」吳芝生希望能用自己的技藝為兩岸交流作點貢獻。
「《湄洲媽祖風光》是一幅以莆田湄洲島為藍本設計雕刻而成的軟木畫。為了創作這幅作品，我前後去了十幾趟湄洲島，膠卷拍了五六卷，花了半年時間才完成。」吳芝生表示，創作軟木畫工序複雜，並不是一開始就上手製作，首要設計草圖，然後才做「亭台樓閣山水花鳥」等各類零件，做好之後再進行組裝。「要觀察遠近距離，考慮各方面的透視。」
「而如何讓畫面呈現高低遠近的層次感，協調地表現畫面的透視比例等等，則要求作者要有扎實的藝術功底和日常知識積累。」吳芝生笑言，軟木畫已經成為他生活中不可或缺的一部分，儘管滿面皺紋、兩鬢斑白，但每天只要戴上老花鏡，開啟工作台，恍若魔法附身，「心裡就感覺很踏實」，「今年我打算花一年時間創作長2.4米，寬1.2米規格的《北京頤和園》，還要和女兒一起合作《八閩大地展風采》，將武夷山玉女峰、大王峰，廈門鼓浪嶼，福州西湖，泉州開元寺等集中起來創作。」