1.「變革性技術關鍵科學問題」重點專項，將圍繞信息、能源、地學、製造、材料、生命科學及交叉等6個領域方向部署項目，優先支持37 個研究方向。2018年度擬部署項目的國撥經費總概算為9.7 億元（人民幣，下同）。
2.「發育編程及其代謝調節」重點專項，將圍繞器官發育與穩態編程及其代謝調節、營養與環境對器官發育和穩態的調節機制、代謝和發育紊亂相關疾病的發生發展機制、發育與代謝研究技術創新和資源庫等4 個重點任務部署項目，擬優先支持15 個研究方向。國撥經費總概算約4.90 億元。
3.「合成生物學」重點專項，將圍繞基因組人工合成與高版本底盤細胞、人工元器件與基因線路、人工細胞合成代謝與複雜生物系統、使能技術體系與生物安全評估等4 個任務部署項目。中央財政和深圳市聯合出資，共同組織實施「合成生物學重點專項」。2018 年度專項擬部署項目的國撥經費總概算為8.37 億元。