學生會幹事會一直由「獨莊」把持，前會長孫曉嵐於2016年開學禮上致辭時公然稱「香港並非中國，在校園討論『港獨』不應成禁忌」。
2017年時任會長黃政鍀鼓吹學生「學習」周永康、梁天琦、馮敬恩等多名涉暴力違法案件的港大校友，變相鼓吹學生違法。
2018年一屆的會長黃程鋒美化「佔中」暴徒為英雄，鼓吹新生「造反」，更在修例風波期間稱要撥款100萬元為港大暴徒提供法律援助。
今年初卸任的2020年會長葉芷琳，去年曾公開聲言「『港獨』是最理想的出路」，又於開學迎新辭將黑暴行為美稱為「責任」，污衊警方「圍攻大學、無差別攻擊市民」，及將反修例的暴徒美化為「香港民主女神像」，大力煽動暴力，鼓動無辜新生在前線衝鋒陷陣、為所謂「政治理想」犧牲云云。
葉芷琳任內的港大學生會，更多次於校內舉辦多項煽「獨」活動。今年2月初，他們將旺角暴動扭曲為所謂「魚蛋革命」，在校內舉辦攝影展及放映會，更包括三場吹捧「獨」人梁天琦的紀錄片《地厚天高》放映會，利用大學場所宣揚暴力違法的「獨」訊息。