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在確保供應充足的同時，中央政府對內地供港食品安全一直高度關注，質檢總局高層在年前對內地供港蔬菜質量把關上有專門批示，明令質檢部門確保香港「菜籃子」安全衛生穩定。
據了解，質檢總局已建立了從源頭基地抓起、全過程監管的供港蔬菜質量保證體系。不僅出台專門的供港澳蔬菜檢驗檢疫管理辦法等規章制度，還在日常對供港蔬菜基地實行「全過程」監管。截至目前，由質檢總局審核批准的備案供港蔬菜達703個（面積共計76.8萬畝）。
菜廠配備藥殘快速檢測
同時，質檢總局亦要求企業建立自檢自控體系，供港蔬菜加工廠必須配備藥殘快速檢測儀，有條件的還配備了氣相色譜儀等高精度儀器。此外，質檢總局開始積極試用高科技GPS電子鎖對供港蔬菜運輸進行全程監控，以防止夾帶、換貨等違規行為。
在活豬方面，相關養殖場建立了生豬健康技術服務中心和實驗室，聘請養殖、疾病防治專家，為生豬健康提供技術服務。同時，嚴格免疫、消毒防疫、種豬引進隔離等一系列疾病防治措施，對生產生豬的內外環境嚴格要求。
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